Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TOP1MTQ969P6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOP1MTQ969P6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms