Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
USP13Q92995 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP13Q92995 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP13Q92995 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP13Q92995 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP13Q92995 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP13Q92995 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP13Q92995 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP13Q92995 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP13Q92995 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP13Q92995 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP13Q92995 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP13Q92995 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP13Q92995 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP13Q92995 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP13Q92995 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP13Q92995 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP13Q92995 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP13Q92995 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP13Q92995 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP13Q92995 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP13Q92995 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP13Q92995 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP13Q92995 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP13Q92995 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP13Q92995 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP13Q92995 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP13Q92995 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP13Q92995 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP13Q92995 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP13Q92995 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms