Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PHF3Q92576 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PHF3Q92576 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHF3Q92576 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHF3Q92576 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHF3Q92576 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PHF3Q92576 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF3Q92576 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF3Q92576 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF3Q92576 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF3Q92576 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PHF3Q92576 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms