Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA9

SREK1, Splicing regulatory glutamine/lysine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREK1Q8WXA9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SREK1Q8WXA9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SREK1Q8WXA9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SREK1Q8WXA9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms