Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
DDX54Q8TDD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
DDX54Q8TDD1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
DDX54Q8TDD1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms