Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GADD45GIP1Q8TAE8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms