Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND76

CCNY, Cyclin-Y, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYQ8ND76 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNYQ8ND76 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNYQ8ND76 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms