Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMG8Q8ND04 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMG8Q8ND04 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms