Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TMEM229BQ8NBD8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TMEM229BQ8NBD8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms