Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RYBPQ8N488 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RYBPQ8N488 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms