Protein–RNA interactions for Protein: Q8N183

NDUFAF2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF2Q8N183 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFAF2Q8N183 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDUFAF2Q8N183 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms