Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHACTR4Q8IZ21 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHACTR4Q8IZ21 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms