Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTN4Q8IWV2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNTN4Q8IWV2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNTN4Q8IWV2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms