Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KSR1Q8IVT5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KSR1Q8IVT5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms