Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CNGA4Q8IV77 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNGA4Q8IV77 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNGA4Q8IV77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms