Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TREML1Q86YW5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TREML1Q86YW5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms