Protein–RNA interactions for Protein: Q86WR0

CCDC25, Coiled-coil domain-containing protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25Q86WR0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC25Q86WR0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC25Q86WR0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms