Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YTHDF3Q7Z739 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YTHDF3Q7Z739 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms