Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5N4

SDK1, Protein sidekick-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK1Q7Z5N4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SDK1Q7Z5N4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDK1Q7Z5N4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms