Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z403

TMC6, Transmembrane channel-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC6Q7Z403 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMC6Q7Z403 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMC6Q7Z403 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms