Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LPCAT2Q7L5N7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LPCAT2Q7L5N7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms