Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF493Q6ZR52 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ZNF493Q6ZR52 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms