Protein–RNA interactions for Protein: Q6XE38

SCGB1D4, Secretoglobin family 1D member 4, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB1D4Q6XE38 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SCGB1D4Q6XE38 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms