Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY01

LRRC31, Leucine-rich repeat-containing protein 31, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC31Q6UY01 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRRC31Q6UY01 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRC31Q6UY01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC31Q6UY01 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC31Q6UY01 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC31Q6UY01 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC31Q6UY01 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC31Q6UY01 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC31Q6UY01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC31Q6UY01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC31Q6UY01 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRC31Q6UY01 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms