Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC171Q6TFL3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCDC171Q6TFL3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC171Q6TFL3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms