Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
USP17L2Q6R6M4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
USP17L2Q6R6M4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms