Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ZBED9Q6R2W3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZBED9Q6R2W3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZBED9Q6R2W3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms