Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
APOA5Q6Q788 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms