Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KCNIP4Q6PIL6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KCNIP4Q6PIL6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms