Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZCCHC12Q6PEW1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZCCHC12Q6PEW1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms