Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TTC41PQ6P2S7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC41PQ6P2S7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TTC41PQ6P2S7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms