Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EDC4Q6P2E9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
EDC4Q6P2E9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EDC4Q6P2E9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EDC4Q6P2E9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EDC4Q6P2E9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EDC4Q6P2E9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
EDC4Q6P2E9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
EDC4Q6P2E9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
EDC4Q6P2E9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
EDC4Q6P2E9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms