Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KCTD16Q68DU8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms