Protein–RNA interactions for Protein: Q68DH5

LMBRD2, LMBR1 domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD2Q68DH5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMBRD2Q68DH5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD2Q68DH5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms