Protein–RNA interactions for Protein: Q68D06

SLFN13, Schlafen family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN13Q68D06 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLFN13Q68D06 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLFN13Q68D06 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms