Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
USPL1Q5W0Q7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
USPL1Q5W0Q7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
USPL1Q5W0Q7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms