Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ89

DENND4C, DENN domain-containing protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND4CQ5VZ89 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DENND4CQ5VZ89 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DENND4CQ5VZ89 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DENND4CQ5VZ89 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms