Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
C9orf84Q5VXU9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
C9orf84Q5VXU9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.82■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.8■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
C9orf84Q5VXU9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms