Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV11

Putative UPF0633 protein ENSP00000303136, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VV11 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VV11 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VV11 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VV11 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VV11 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VV11 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VV11 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VV11 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q5VV11 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Q5VV11 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q5VV11 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q5VV11 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q5VV11 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q5VV11 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q5VV11 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Q5VV11 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms