Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACHD1Q5VU97 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CACHD1Q5VU97 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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