Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CCDC18Q5T9S5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CCDC18Q5T9S5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms