Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6V5

C9orf64, Queuosine salvage protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf64Q5T6V5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C9orf64Q5T6V5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf64Q5T6V5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf64Q5T6V5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf64Q5T6V5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf64Q5T6V5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf64Q5T6V5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf64Q5T6V5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf64Q5T6V5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf64Q5T6V5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf64Q5T6V5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf64Q5T6V5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms