Protein–RNA interactions for Protein: Q5T619

ZNF648, Zinc finger protein 648, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF648Q5T619 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZNF648Q5T619 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZNF648Q5T619 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF648Q5T619 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF648Q5T619 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF648Q5T619 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF648Q5T619 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF648Q5T619 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF648Q5T619 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZNF648Q5T619 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms