Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC183Q5T5S1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC183Q5T5S1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC183Q5T5S1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms