Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMPK2Q5EBM0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMPK2Q5EBM0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms