Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAVIN4Q5BKX8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAVIN4Q5BKX8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAVIN4Q5BKX8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms