Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COBLL1Q53SF7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COBLL1Q53SF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COBLL1Q53SF7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms