Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C4orf46Q504U0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C4orf46Q504U0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms