Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC38Q502W7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC38Q502W7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms