Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYTL3Q4VX76 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYTL3Q4VX76 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms